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2023年8月7日 · 博文. 梅利尼科夫方法 (中条) 已有 1831 次阅读 2023-8-7 22:54 | 个人分类: 科研科普 | 系统分类: 科普集锦. 梅利尼科夫方法是判断受小周期扰动的平面可积系统出现横截同宿点的解析方法，其适用条件是未受扰动的平面可积系统存在双曲鞍点和联接鞍点的同宿轨道或异宿环。 对于受扰动系统，先通过庞加莱映射将非自治平面连续系统转化为平面离散系统。 在小扰动的情形，原系统的双曲鞍点小邻域内有相应平面映射的双曲鞍点，其稳定流形与不稳定流形之间的距离经过一阶近似简化后，可写作一种便于计算的形式，即梅利尼科夫函数。 如果该函数有简单零点，稳定流形和不稳定流形必横截相交而形成同宿点。 用稳定流形和不稳定流形之间的“分裂距离”判断相交的思想出自1890年H.
2019年6月10日 · 本文提出一种新的方法FEAST，可以实现快速、更准确的微生物来源追踪； 软件基于R语言开发，保证了方法跨平台的可用性； 应用于婴儿和厨房两个微生物组项目，结果的微生物来源解释比例更合理； 此方法在分类问题中，也比JSD、加权UniFrac指标有更好的AUC值，在医学诊断中有更好的应用前景。 摘要. 分析微生物组数据的组成结构的一个主要挑战是确定其潜在来源。 在这里，我们介绍了快速期望最大化微生物源跟踪工具（Feast），这是一个随时可用的可扩展框架，可以同时及时估计数千个潜在源环境的贡献，从而帮助解开复杂微生物群落的起源。 源代码见 https://github.com/cozygene/feast 。
2014年2月23日 · Hindcast用于科学领域最早可能是在海浪的研究中，与二战时的军事登陆有关，这个词迄今尚未进入一般的英语辞书。. Hindcast的汉译，在大陆通常译作“后报”、近来也有译作后向预报；在台湾一般译作“追算”。. 据一篇台湾文献介绍（ http://ocean.cv.nctu ...
2016年3月30日 · 博文. metagenomeSeq的原理介绍. 已有 10936 次阅读 2016-3-30 11:41 | 个人分类: 科研文章 | 系统分类: 科研笔记 | metagenomeSeq. metagenomeSeq是用R开发的一个包，其安装可以直接R CMD INSTALL metagenomeSeq_1.12.0.tar.gz，不过metagenomeSeq依赖Biobase、BiocGenerics、limma等包，需要把这些安装OK后才能顺利安装metagenomeSeq。
2022年3月15日 · 取种群的逻辑斯蒂增长方程中的两个字母【dN/dt=rN(1-N/K)】，将其命名为r-K选择（r-K selection）。r-选择的生物，简单来说是以数量取胜。他们想尽办法，快速产仔。繁殖能力强、个体小、性成熟早，世代短、每窝产仔多（高r），但是个体成活比例低（低
2012年7月14日 · 我认为这样的普通的研究生应该占到总体的80%以上。. 首先，我认为“研究生培养”，包括硕士和博士培养，就是一个科研训练而已，不是培养天才，导师自己也不是天才。. 一个自然科学研究项目的周期包括：定义问题 - 文献调研 - 思考提议 - 动手实验 - 数据 ...
2017年11月24日 · Sequencher 4.5日常使用流程记录. COI基因片段. 平时常规测序时得到的序列，需要简单处理一下，通常使用Sequencher 4.5进行操作。 流程如下： Windows中打开Sequencher 4.5→直接导入双向后缀为abi的文件（共两个）→点击assembly automatically→双击小图标→点击base→点击show chromatograms→检查错误. ①检查是否标有“·” ②有的话，改成质量较好的碱基位点：a.上下对应位点颜色不一样的，改成浅色的。 b.上下位点一样的，按照峰图更高的改。 改好后，输出格式改为fasta。 保存。 自行修改后缀。 转载本文请联系原作者获取授权，同时请注明本文来自东洁科学网博客。
