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    • 邓紫棋

      基本信息. 邓紫棋(G.E.M.),本名邓诗颖,1991年8月16日出 ...

  2. 2022年2月24日 · 鉴于此,百度提出一种全新的基于空间结构的化合物建模方法——几何构象增强AI算法GEM,并设计了多个几何级别的自我监督学习策略,用于学习化合物的空间结构知识,使得化合物的表征能自主推断出空间结构信息。 这项技术在十多个基准的化合物属性预测数据集上均取得出色成绩,并成功应用到候选化合物的ADMET成药性预测任务上,取得良好收益。 解读几何构象增强AI算法GEM模型. 几何构象增强AI算法GEM模型包含两个主要部分:基于空间结构的图神经网络(a)和多个几何级别的自监督学习任务(b)。 图1: GEM的整体框架. 1. 基于空间结构的图神经网络. 由于化合物的集合结构可以完全被原子-化学键键长-键角确定。 GEM提出了一种基于空间结构的图网络,同时对原子-化学键-键角的关系建模空间结构信息。

  3. 2022年2月7日 · 145 Citations. 30 Altmetric. Metrics. A preprint version of the article is available at arXiv. Abstract. Effective molecular representation learning is of great importance to facilitate molecular...

    • Xiaomin Fang
  4. 2022年2月28日 · 什么概念呢? 作者形容,“比太阳系的原子数量还要多”。 要在这样一个庞大「小分子宇宙」中寻求合适的候选药物,高效准确的化合物表征就起到关键作用。 基于这样的背景下,研究团队此次的研究提出了几何增强型的分子表征方法,简称GEM。 这个方法主要包含两个部分:基于空间结构的图神经网络GNN、以及多个几何级别的自监督学习。 不难看出,本次研究的亮点在于空间、几何。 据介绍,这是业界首次将空间结构引入到化合物建模当中。 之所以这样强调,跟他们要解决的问题不无关系,那就是让AI也能理解小分子的3D结构。 个中原因,需要从现有表征方式说起。 目前研究主要有两种表征方式:基于序列的一维表征和基于图形的表征。

  5. 2022年2月23日 · 鉴于此百度提出一种全新的基于空间结构的化合物建模方法——几何构象增强AI算法GEM并设计了多个几何级别的自我监督学习策略用于学习化合物的空间结构知识使得化合物的表征能自主推断出空间结构信息。 这项技术在十多个基准的化合物属性预测数据集上均取得出色成绩,并成功应用到候选化合物的ADMET成药性预测任务上,取得良好收益。 03解读几何构象增强AI算法GEM模型. 几何构象增强AI算法GEM模型包含两个主要部分:基于空间结构的图神经网络(a)和多个几何级别的自监督学习任务(b)。 图1:GEM的整体框架. 基于空间结构的图神经网络. 由于化合物的集合结构可以完全被原子-化学键键长-键角确定。 GEM提出了一种基于空间结构的图网络,同时对原子-化学键-键角的关系建模空间结构信息。

  6. 2022年2月23日 · 鉴于此,百度提出一种全新的基于空间结构的化合物建模方法——几何构象增强AI算法GEM,并设计了多个几何级别的自我监督学习策略,用于学习化合物的空间结构知识,使得化合物的表征能自主推断出空间结构信息。 这项技术在十多个基准的化合物属性预测数据集上均取得出色成绩,并成功应用到候选化合物的ADMET成药性预测任务上,取得良好收益。 解读几何构象增强AI算法GEM模型. 几何构象增强AI算法GEM模型包含两个主要部分: 基于空间结构的图神经网络(a)和多个几何级别的自监督学习任务(b)。 图1: GEM的整体框架. 1. 基于空间结构的图神经网络. 由于化合物的集合结构可以完全被原子-化学键键长-键角确定。 GEM提出了一种基于空间结构的图网络,同时对原子-化学键-键角的关系建模空间结构信息。