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  1. 在5号染色体的合成工作中研究团队建立了基于多靶点片段共转化的基因组精确修复技术和DNA大片段重复修复技术解决了超长人工DNA片段的精准合成难题团队首次实现了真核人工基因组化学合成序列与设计序列的完全匹配系统性地支撑与评价了当前真核生物的设计原则该技术为研究人工设计基因组的重新设计功能验证与技术改进奠定了基础。 同时,团队还利用化学合成的酵母5号染色体定制化建立了一组环形染色体模型,通过人工基因组中设计的特异性水印标签,实现对细胞分裂过程中染色体变化的追踪和分析,为研究当前无法治疗的环形染色体疾病、癌症和衰老等的发生机理和潜在治疗手段提供了研究模型。 清华大学戴俊彪团队在本次工作中负责设计合成12号染色体。

  2. 破解染色质:新方法绘制基因组结构. 几十年来研究人员已经认识到癌细胞通常携带大量的染色体异常。. 例如人类第9和第22染色体的易位连接片段产生了所谓的费城染色体”,这是一种与慢性粒细胞白血病相关的结构异常。. 而某些形式的前列腺癌与基因 ...

  3. 2020年12月17日 · 染色质免疫沉淀(ChIP)是分子生物学中应用最广泛的技术之一,它已经有30多年的历史,有些技术已经发生了变化,而有些则保持不变。 ChIP的基本操作方案仍与上世纪80年代开发的方案类似,涉及用甲醛将蛋白质与DNA交联,然后对DNA进行剪切。 对于与DNA相互作用的蛋白质使用抗体进行免疫沉淀,加热解除交联,并分析捕获的DNA。 研究人员后来将这项技术与深度测序联系起来,开发出ChIP-seq技术,在基因组层面探索蛋白质与DNA的相互作用。 ChIP被广泛地用于研究转录因子工作原理、组蛋白对基因表达的调控机理以及其它与生物发育和疾病相关的基本问题。 2018年9月,C. David Allis和Michael Grunstein因基于ChIP的组蛋白研究成果获得著名的拉斯克奖。

  4. 2014年3月12日 · Gabriel说,布罗德研究所已经解码了“超过十万个左右的外显子组”(对比哈佛大学遗传学家George Church所估计的数字,迄今得到测序的人类全基因组只有约17000个)。 Gabriel说她的仪器测序外显子组的数量是全基因组的4倍,具有每周测序约2000个外显子组的能力。 这得益于超过50台Illumina-HiSeq 2000和2500测序仪,这些仪器大部分在国家心脏、肺与血液研究所的外显子测序大项目课题中安装。 在该基因发掘项目中,布罗德研究所和华盛顿大学共同测出7500个外显子组。 据霍华德休斯医学研究会研究员Richard Lifton说,耶鲁大学的十台HiSeq测序仪仅在去年就解码出了12000个外显子组。

  5. 2020年6月7日 · “我们的目标是制造一种RNA靶向技术,我们可以用它来探索人类细胞中的RNA生物学,” Cate说。 他们想要利用RNA引导的蛋白质来定位RNA,作为用共价键标记RNA的替代方法。 Cate团队的一名成员、博士后研究员Audrey Lapinaite发现,主要的挑战是“如何将向导RNA装入细胞内的MpAgo”,Cate说。 她解决了这个问题,在体外组装了向导RNA-蛋白复合物(RNPs),然后在细胞实验中使用RNPs。 Lapinaite发现,对向导RNA的5’-核苷酸进行修饰后,可以生成易于编程的RNPs,其与完全互补的RNA靶标具有很高的亲和力。 此外,经修饰的RNPs具有较高的特异性,可以区分仅有一个核苷酸差异的RNA底物。 Cate对使用MpAgo RNPs操纵RNA的前景感到兴奋。

  6. 2020年10月26日 · 贝伊鲁瑟团队研究确定A4蛋白属于较大的神经元蛋白——淀粉样前体蛋白APP的一个片段。 随后,他们在21号染色体上找到了编码APP的基因。 这条线索为格列纳等人提出的“阿尔茨海默病基因”假说提供了证据。

  7. 2021年11月18日 · ”Cas9是一种来自细菌抗病毒系统的酶,它在与引导RNA(gRNA)互补的DNA位点上产生DSB,并且在其附近还有一个前间区序列邻近基序(PAM)序列。 编辑不需要CRISPR重复,所以Cas9加上一个gRNA可以通过NHEJ敲除基因。 提供一个DNA片段可促进HDR介导的编辑。 西雅图艾伦细胞科学研究所干细胞和基因编辑主任,也是LSINW小组成员的Ru Gunawardane指出,CRISPR在完成该研究所的使命——即了解细胞在正常、疾病和治疗条件下是如何行动的方面一直是“游戏规则的改变者”。 该研究所的研究人员在含有荧光蛋白的干细胞中使用CRISPR标记细胞器标记物,然后跟踪这些融合蛋白及其在不同情况下的相互作用。 目前,他们的工作包括将标记细胞分化为心肌细胞。