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2021年6月15日 · 这样能发现很多低相似度的序列，但是比对的速度会慢很多（因为比对的数据量大了6倍）。. 计算量大，耗费时间长。. 比对在正常进行中的，等吧. 时间久也正常，用得人多了可能会慢一点。. 外国网站的话可以下个蓝灯，不用升级VIP，外国人文章中的网站，开 ...
NCBI开发有Genbank等公共数据库，提供 Pubmed、BLAST、Entres、OMIM、Taxonomy、Structure等工具，可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析，并开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。
BLAST工具是进行这种比对的常用方法，它可以在NCBI的官方网站上找到。. 通过BLAST，用户可以提交自己的16S rRNA序列，然后与数据库中的序列进行比对，以找到最相似的序列和可能的分类信息。. 选择 standard databases. 问题如下：1.在进行比对的时候，应该选择standard ...
2023年10月23日 · 在NCBI的数据库中，标记为“PREDICTED”的基因通常基于自动的计算方法，如基因预测算法，而不是实验验证。. 这意味着这些基因的存在、位置和功能尚未经过实验室验证。. 是否有必要研究或使用“PREDICTED”的基因取决于你的研究目标和背景：. 1.初步的研究或 ...
知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容，聚集了中文互联网科技、商业、影视 ...
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2020年8月3日 · 知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台，于 2011 年 1 月正式上线，以「让人们更好的分享知识、经验和见解，找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容，聚集了中文互联网科技、商业、影视 ...
2019年10月20日 · 4. 前几种的方法难点在于，各基因组所用的基因编号不一定统一，所以还是推荐直接自己本地blast比。PS. 至于拷贝数，因为甘蓝与白菜相当于拟南芥的3倍体，甘蓝型油菜又是白菜与甘蓝的杂交加倍。所以一个拟南芥基因在甘蓝型油菜中平均可能有6个拷贝。
NCBI中BLAST以后，会有一个相似性高低的搜索结果，你可以根据E-score的高低排序，筛选出不同物种的序列。. 具体步骤可参考我的专栏MEGA进化树分析中的一篇详细的教程，里面也有注意事项哈。. 知乎，中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台 ...
BLAST之后，如果找到同源序列，就会出现下面这种样子的结果。. 点最右侧的Accession列，就能转到具体的序列页面，复制粘贴或下载都行；或者在该页面勾选想要的序列，然后点击中间那块的Download按钮下载。. 可以用网页版的打印，然后另存为PDF，可以导出一个 ...
