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PubChem (pubchem.ncbi.nlm.nih.gov) PubChem is a freely available database that contains the chemical structures and biological activities for over 19 million small organic molecules. Developed in 2004 by the NCBI, it contains structure, nomenclature, and physico-chemical data.
2022年2月28日 · 更重要的是,通过PUG REST接口,还可以方便地获取到其他服务无法提供的PubChem记录的信息。 下面介绍根据化合物名称,获取化合物的其他数据,包括化学式、分子量、SMILES结构、3D结构、电荷分布等等应有尽有,非常适合批量的化学分子转换和下载。
第一步:PubChem输入成分名称,可以得到结构或者SMILES号. 第二步: SwissADME 导入结构或者粘贴SMILES号,点击Run! 通过类药性五原则判断成分取舍。. 第三步: SwissTargetPrediction 预测符合要求的成分靶点,输入SMILES号预测. 2、DrugBank数据库预测常见成分靶点(西药 ...
2008年1月1日 · 1. INTRODUCTION. PubChem [1], an open repository for experimental data identifying the biological activities of small molecules, is a part of the Molecular Libraries and Imaging (MLI) component of the National Institutes of Health (NIH) Roadmap for Medical Research initiative [2]. This program includes the Molecular Libraries Screening Center ...
2020年7月1日 · 普通有机分子去pubchem、spiderchem搜,里面有的结构是自动根据二维结构产生的,如果在CCDC等库里有晶体结构,页面上也会有提示,届时可考虑用晶体结构(但要注意晶体环境和溶液环境的差异对柔性分子构象影响可能很明显) 至于固醇和磷脂分子,去看膜力场 ...
以Aspirin为例,PubChem可以帮助用户查找特定化合物的结构和性质,探索已知的生物活性数据,并在研究过程中提供宝贵的参考信息。 PubChem化合物数据库包含了数亿个化合物的记录,对科学家、研究人员非常有用。
PubChem数据库于2004年正式对方开放使用,这是一个可以免费获取使用的数据库,其中包含了很多与有机小分子化学结构及其生物活性相关的信息。. 它包含了结构、命名和计算物理化学数据,并与NIH PubMed/ Entrez信息链接。. PubChem的数据信息被划分成三个相互关联的 ...
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2021年11月25日 · 某些文献里可能会总结,不过我没有查过这些. 推荐两个大型化合物 数据库:美国国立卫生研究院的Pubchem和Chemspider,,一般物质理化数据应该都有,如果这里面也没有的话,就该去Web of science上找了). 1)Pubchem : pubchem.ncbi.nlm.nih.gov. PubChem是美国国立卫生研究院 ...
2010年12月1日 · PubChem consists of three interconnected databases: Substance, BioAssay and Compound. The Substance database contains the descriptions of molecules (primarily small molecules) provided by depositors; the BioAssay database contains the screening results of substances by assay providers; and the Compound database contains unique chemical structures derived by structural standardization of the ...