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2021年10月30日 · 孔繁毅表示，若第三針選擇繼續接種科興疫苗，「可能半年（後）又要再打都唔定」。（資料圖片／羅君豪攝） 新冠疫苗顧問專家委員會成員劉宇隆在商台節目《政經星期六》表示，政府應先為長者及免疫力低的人士打第三針，最終推展到全民，由60歲推展至18歲，亦應將「完成接種」的定義改為三 ...
孔繁毅在接受CNN采访时说：“如果看看香港的数据，那么就控制传染而言，戴口罩很可能是最重要的事情。 孔繁毅说：“它不仅能降低新冠病毒病例数量，还能减少流感病例。”他说：“事实上，现在正是流感季节，而我们几乎看不到任何流感病例。[1]
2022年11月14日 · 不過，孔繁毅提醒，明年初是本港流感高峰期，若先後感染流感及新冠病毒，會有機會引致併發症，導致病情會更嚴重。他續指，屆時確診數字有機會突然飆升，擔心院舍長者如未完成接種及近年未感染流感，或有大爆發；又強調入冬後戴口罩對防疫十分重要。
2023年11月1日 · 孔繁毅強調，高危人士有需要及早用藥。 孔繁毅指：「如果錯過治療黃金時間，很多時會出現炎症，抑或有其他併發症甚至失救。 」 現時60歲或以上人士，或未滿60歲的高風險人士，可免費獲處方輝瑞和默沙東的新冠口服藥。
2022年11月24日 · 孔繁毅表示，新冠病毒會降低免疫力，有機會激活疱疹病毒。 （資料圖片） 大公文匯全媒體報道：政府專家顧問、疫苗可預防疾病科學委員會成員孔繁毅今日（24日）表示，新冠病毒會降低免疫力，有機會激活疱疹病毒，包括由水痘帶狀疱疹病毒引致的「生蛇」。
2023年1月31日 · 孔繁毅：檢視檢討也助提升香港整體醫療系統 他認為，相關的檢視實質也不僅著眼於提升本港應對未來疫情能力，也能針對整體醫療系統的提升，尤其是長者照顧方面：「所以我相信有一個獨立調查委員會，會畀到我哋一個更加客觀，更加針對我哋醫療系統問題嘅一個報告，效果可能會更加好。
2023年7月8日 · 孔繁毅：「如果香港本身有自己的生產線，可以透過香港自己的廠房、自己的生產線去做這些疫苗及藥物，這變了真的『一條龍』，一氣呵成。由一個在實驗室的研究，我們可以把它轉化出來，在我們的病人做一、二、三期臨床研究的話，相信用的時間，甚或乎研發完成功註冊的時間可以大大縮短。
